Il va droit à la porte de l'humain. Il attend que cette porte s'ouvre. La porte de l'humain, c'est le visage. Voir face à face, seul à seul, un à un.

L’orthogenèse, théorie du XIXᵉ siècle, postulait une évolution linéaire et dirigée vers des formes prédéterminées, parfois jusqu’à l’extinction (hypertélie). Cette vision s’oppose radicalement à l’arbre phylogénétique actuel, fondé sur les travaux de Woese (1990), qui divise le vivant en trois domaines : Bacteria, Archaea et Eucarya2. 

Or, les Prototaxites défient ces cadres. En nous appuyant sur les données scientifiques actuelles voici où on pourrait - hypothétiquement - les placer. 

Domaine : Eucarya (organismes à cellules complexes)

Super-règne : Opisthokonta (groupe incluant champignons et animaux, par défaut faute de mieux)

Royaume : Incertain – probablement proche des Fungi (champignons), mais avec des divergences majeures.

Branche : Une ramification parallèle aux Basidiomycètes et Ascomycètes, ou peut-être un groupe frère des Gloméromycètes (champignons symbiotiques anciens).

Hypothèses de visualisation sur LifeMap

Si les Prototaxites figuraient sur la plateforme lifemap, il seraient probablement représenté :

En périphérie des Fungi, avec un point d’interrogation iconographique.

Sur une branche indépendante, reliée aux premiers eucaryotes terrestres du Paléozoïque inférieur.

En superposition avec les lichens ou les algues symbiotiques, reflétant les débats sur sa nature hybride.

Obstacles techniques

1 - Absence de matériel génétique : Les fossiles ne conservent pas d’ADN, empêchant une analyse moléculaire.

2 - Classification controversée : Sans consensus, LifeMap pourrait les exclure de ses arboressences, ou les classer sous " incertae sedis " ( position incertaine ).

Dans un monde où les arbres n’existaient pas encore et où les paysages terrestres étaient dominés par des mousses et lichens modestes, une énigme colossale surgit des profondeurs du passé : les Prototaxites. Découverts pour la première fois en 1859, ces fossiles gigantesques, datant de 400 millions d’années, défient encore aujourd’hui les classifications biologiques et nourrissent un débat scientifique passionné.

Un géant du Dévonien

Les Prototaxites se dressaient comme des monolithes dans un environnement primitif. Hauts de 2 à 8 mètres et atteignant parfois un mètre de diamètre, ces organismes dominaient un monde où aucune plante ne dépassait la taille d’un arbuste. Leur structure évoquait celle de troncs d’arbres, avec des cercles concentriques rappelant les cernes de croissance. Pourtant, ils ne pouvaient être des arbres, car ils prospéraient bien avant l’apparition des forêts modernes.

Une identité insaisissable

Depuis leur découverte, les Prototaxites ont été successivement classés comme conifères primitifs, algues géantes, lichens ou champignons. Chaque hypothèse semblait plausible avant d’être remise en question par de nouvelles découvertes. En 2007, une analyse isotopique révéla que leur composition chimique différait de celle des plantes contemporaines et suggéra une nature fongique. Pourtant, des études récentes ont semé le doute : l’absence de chitine (caractéristique des champignons) et la présence de composés similaires à la lignine (associée aux plantes) compliquent davantage leur identification.

Un organisme unique ?

Certains chercheurs avancent que les Prototaxites pourraient représenter une branche totalement perdue de l’arbre du vivant. Ni plante, ni animal, ni champignon au sens strict, ils pourraient incarner une expérience évolutive distincte, témoignant d’une diversité biologique aujourd’hui disparue. Leur structure interne complexe – des tubes ramifiés et emboîtés sans équivalent connu – suggère une organisation multicellulaire unique.

Le rôle écologique d’un colosse

Dans cet écosystème primitif, où la vie terrestre était encore balbutiante, les Prototaxites auraient pu jouer un rôle central. Peut-être étaient-ils des décomposeurs majeurs, recyclant la matière organique morte pour enrichir les sols. D’autres hypothèses évoquent une symbiose avec des algues ou des micro-organismes photosynthétiques. Leur gigantisme soulève également des questions : pourquoi atteindre de telles tailles dans un environnement dépourvu de compétition végétale significative ? Était-ce une stratégie pour capter plus efficacement la lumière ou pour dominer l’écosystème microbien ?

Un mystère qui persiste

Malgré plus de 160 ans d’études, les Prototaxites restent une énigme scientifique. Leur disparition il y a environ 370 millions d’années demeure tout aussi mystérieuse. Ont-ils été supplantés par l’émergence des premières forêts ? Ou bien s’agissait-il d’une impasse évolutive condamnée par des changements environnementaux majeurs ?

Ces fossiles monumentaux nous rappellent que l’histoire de la vie sur Terre est jalonnée d’expériences biologiques extraordinaires, dont certaines n’ont laissé aucune descendance moderne. Les Prototaxites, géants solitaires du Dévonien, incarnent cette richesse perdue et continuent d’alimenter notre fascination pour les mystères du passé profond.



 

Rien n'est plus certain, pour nous, que ce dont nos sens témoignent, quand il s'agit de l'ordre naturel de nos connaissances. Et c'est même par là, nous l'avons dit, que dans cet ordre naturel de nos connaissances, toute certitude s'établit pour nous, en première origine, puisque aussi bien tout ce qu'il y a de vérité objective ou de réalité dans la première de toutes nos idées, l'idée d'être, nous est venu, en première origine, des sens.

On s'étonne encore de déceler une réaction puérile chez un de nos semblables, mais c'est une grossière erreur : il n'y a pas d'adultes au comportement d'enfant, il n'y a que des enfants qui ont atteint l'âge où le doute est honteux. Des enfants qui finissent par se conformer à ce que l'on attend d'eux : qui renoncent à la moindre remise en question, affirment sans plus trembler, méprisent la différence. Des enfants aux voix rauques, aux cheveux blancs, à l'alcool facile.

Il est possible que, la médecine ayant disparu, la vie devienne plus brève. Mais si on vit plus lentement, si les jours et les années ne passent plus devant notre nez à une vitesse effrayante, si on a le temps de vivre enfin, je me demande ce qu’on a perdu.

J’ai passé beaucoup de temps chez les Tekos amazoniens dernièrement. Voilà ce que j’ai écrit à ce sujet :

Le cachiri a fait effet — heureusement que j’aime cette boisson, j’en ai bu des litres.

Ils ont dit oui pour le projet de film. Je m’attendais à un non. Pour certains, c’est historique : première fois qu’ils parviennent à se réunir et à trouver un accord depuis bien longtemps, depuis la fin des chamanes. Je ne crie pas victoire. Ici, les choses sont aussi changeantes qu’une rivière en saison des pluies. Ce furent six heures de boisson. Le cachiri était fort. Mélangé à des fruits de parepou, il devient rapidement alcoolisé. C’était le but : il fallait l’ivresse pour trouver la concorde. Les chefs coutumiers ont scellé l’accord. J’ai pu assister à une palabre teko. On ne peut nier qu’il y a un vrai sens démocratique dans la façon de se réunir et de prendre la parole. Nous avons tous commencé assis sur les bancs longeant le carbet communautaire, puis, progressivement, nous nous sommes levés pour former un cercle. Les voix se sont alors affirmées, et le débat a été tranché en faveur du film. Moment très intéressant de démocratie directe, délibérative, chacun ayant le droit à la parole, exposant ses arguments pour ou contre, j’étais en pleine amazonie mais je ne pouvais m’empêcher de penser à l’Athène des sophistes, à l’émergence du débat contradictoire dans notre culture Européenne.  J’ai fini la journée desséché par tout le cachiri ingurgité. J’ai dû boire trois litres d’eau pour maintenir un semblant d’homéostasie.

La nuit fut agitée de rêves : j’ai rêvé d’un lynx qui tuait un serpent à quatre ou cinq têtes…

Je suis avec attention les billets psychanalytiques de Paul Jorion — la question du rêve est fondamentale dans ma vie. Essayer de cartographier l’univers onirique me semble essentiel… Il y a plusieurs niveaux de rêve.

Il y a les rêves liés au quotidien, puis ceux en lien avec l’histoire personnelle, qui peuvent remonter jusqu’à la plus tendre enfance. Mais, pour moi, il existe aussi des rêves d’un autre ordre de conscience, inscrits dans un espace-temps différent. Ce que ChatGPT résume ainsi, lorsque je le questionne :

Rêves de surface — le bruit du jour

Rêves de profondeur — le récit de soi

Rêves d’ouverture — les rêves " hors temps "

Je passe rapidement sur les rêves sériels, car ce n’est pas tout à fait le propos ici. Néanmoins, je peux dire qu’ils fonctionnent par répétitions. Ce sont, pour moi, des messages. Tant que je ne comprends pas, la série se poursuit — mais ce n’est jamais une répétition à l’identique. Le rêve conserve la même thématique, mais la transpose sous d’autres formes. Ces rêves relèvent toujours du type 2, ou en très grande majorité.

Chaque rêveur a, in fine, la clé de ses propres rêves. Un autre humain peut impulser une piste, mais au final, seul le rêveur peut comprendre la finalité de ses images. Je communique beaucoup avec moi-même à travers le rêve. Quand une situation m’échappe, je demande souvent à mon inconscient de m’envoyer les rêves nécessaires pour comprendre.

Cela dit, c’est du troisième type de rêve dont je voulais parler. J’ai commencé à parler des Tekos pour en venir là. Cela fait quatre ans que je fais des allers-retours en forêt pour tenter de faire ce film, et le moins qu’on puisse dire, c’est que la situation a été extrêmement bloquée. J’ai voulu abandonner plusieurs fois. Et à certains moments, si je n’avais pas eu le secours de deux rêves, j’aurais déserté.

Je situe le premier rêve début 2023 — je n’en ai hélas pas noté la date, mais j’ai retrouvé ces lignes dans une correspondance :

Un nouveau chef Teko a été élu, il est proche de moi. Je vais sans doute avoir la chance de pouvoir réaliser ce documentaire.

Siméon est un peu plus jeune que moi, et je suis étonné que la communauté l’ait élu. Généralement, il faut être un peu plus âgé.

Quand je suis allé à Camopi la dernière fois, j’ai fait un rêve, juste avant de partir.

Nous étions tous les deux en forêt, marchant sur un tapis de feuilles sèches près d’une rivière. Soudain, je vois quelque chose bouger sous les feuilles. La bête s’approche. J’ai peur, je recule. Elle sort du tapis, du côté de la rivière. C’est un magnifique serpent de couleur émeraude. Un serpent avec des ailes. Il s’envole.

Quand je raconte ce rêve à Siméon, il me sourit et me dit qu’il a lui aussi rêvé de moi, quelques jours avant mon arrivée. Je ne l’avais pas prévenu.

Le deuxième rêve date de la nuit du 2 au 3 mai 2024 :

Cette nuit-là, j’étais en Amazonie avec les Tekos. Je marchais avec le chef, de réunion en réunion avec les villageois.

Notre marche nous mène, Siméon et moi, devant un attroupement d’hommes qui observent un immense anaconda logé dans un tronc horizontal, creux, plongé dans une crique.

Le serpent était tranquille. Siméon s’approche doucement pour le toucher. Et là, comme un jet, l’anaconda file dans la rivière sous nos yeux.

J’analyse ce deuxième rêve ainsi : l’anaconda = nous pouvons et allons remonter la rivière.

Cela fait des années qu’elle est bloquée par les Tekos, pour des raisons politiques, à la fois claniques (jeux d’influences entre familles) et liées à l’histoire coloniale (réappropriation d’un pouvoir sur qui peut ou non pénétrer un territoire ancestral, en l’occurrence la rivière Camopi). J’ai fait ce rêve alors que toute la situation dans laquelle je me débattais, semblait dire que le film ne se ferait jamais.

Ce qui se passe est historique pour eux : ils ont recommencé à discuter entre eux, à prendre des décisions collectives et le film maintenant est en très bonne voie pour se faire. 

Alors ces deux rêves — surtout le dernier — je pourrais les qualifier de prémonitoires. 

Ils ne relèvent pas, pour moi, du niveau 1 ou 2, mais bien du niveau 3. 

Je me questionne donc sur le substrat d’où part cette génération d’images oniriques, et sur la fonction qu’on peut lui attribuer.

Les Arcanes des Réseaux de Neurones : Démêler les Fils de l'Attribution

Dans l’univers foisonnant de l’intelligence artificielle, les modèles de langage, tels des alchimistes modernes, transforment des séquences de symboles en réponses cohérentes, en prédictions éclairées, ou en créations inédites. Mais derrière cette magie apparente se cache une mécanique complexe, un entrelacs d’interactions neuronales si denses qu’ils en deviennent presque insondables. C’est dans cet espace nébuleux que s’inscrit l’article en question, une exploration méthodique et audacieuse qui propose une méthode pour cartographier les rouages internes des réseaux neuronaux à travers ce qu’ils appellent les " graphes d’attribution ".

Cette quête n’est pas seulement technique : elle est aussi philosophique. Comment comprendre ce que nous avons créé ? Comment démêler les fils d’un système dont la complexité dépasse parfois celle de l’esprit humain ? La méthode décrite dans cet article se veut une réponse partielle à ces questions vertigineuses.

Le Modèle de Remplacement : Une Fenêtre sur l’Invisible

Pour pénétrer les mystères du fonctionnement interne d’un modèle de langage, les chercheurs ont imaginé une approche ingénieuse : construire un " modèle de remplacement ". Ce dernier n’est pas une simple copie. Il s’agit d’une version simplifiée et interprétable du modèle original, où chaque couche est remplacée par un " transcodeur inter-couches ". Ce transcodeur agit comme un traducteur fidèle mais transparent, capable d’encoder les signaux internes du modèle dans un langage plus accessible.

Ce modèle simplifié devient alors un terrain d’expérimentation. En traçant pas à pas les transformations opérées par le transcodeur, les chercheurs peuvent reconstruire des " graphes d’attribution ", véritables cartes conceptuelles qui révèlent comment le modèle traite et combine les informations pour produire ses réponses.

Les Graphes d’Attribution : Une Cartographie des Interactions Neuronales

Les graphes d’attribution sont au cœur de cette méthode. Ils ne se contentent pas de visualiser les processus internes du modèle : ils en offrent une interprétation causale. Chaque nœud du graphe représente une caractéristique ou un concept abstrait que le modèle a appris à identifier au fil de son entraînement. Chaque arête, quant à elle, symbolise une relation causale entre ces caractéristiques, illustrant comment elles s’influencent mutuellement ou contribuent à la sortie finale.

Ces graphes ne sont pas figés ; ils évoluent selon la tâche ou l’entrée soumise au modèle. Ils permettent ainsi aux chercheurs de suivre le cheminement des idées à travers le réseau neuronal, comme on suivrait le cours sinueux d’une rivière à travers un paysage. Ils révèlent non seulement ce que le modèle " sait ", mais aussi comment il organise et mobilise ce savoir pour répondre à une question ou résoudre un problème.

Études de Cas : Explorer les Mécanismes Cachés

Pour démontrer la puissance explicative des graphes d’attribution, les auteurs ont appliqué leur méthode à plusieurs tâches spécifiques. Chaque étude de cas éclaire un aspect différent du fonctionnement interne du modèle et met en lumière des mécanismes souvent insoupçonnés.

La Création d’Acronymes

Dans cette première exploration, les chercheurs ont examiné comment le modèle génère des acronymes à partir de phrases complexes. Les graphes ont révélé que le modèle identifie d’abord les mots-clés porteurs de sens avant d’en extraire les lettres initiales pour former un acronyme cohérent. Ce processus semble imiter une forme rudimentaire de raisonnement humain.

La Mémoire Factuelle

Dans un autre exemple fascinant, ils ont étudié comment le modèle se souvient de faits appris lors de son entraînement. Les graphes montrent que ces souvenirs ne sont pas stockés comme des entités isolées mais sont intégrés dans un réseau dense d’associations conceptuelles. Ainsi, lorsqu’on interroge le modèle sur un fait précis, il active non seulement l’information pertinente mais aussi tout un réseau connexe qui enrichit sa réponse.

Le Calcul Arithmétique

Enfin, les chercheurs se sont penchés sur la capacité du modèle à effectuer des additions simples. Les graphes ont mis en évidence un mécanisme étonnamment structuré : le modèle décompose l’opération en étapes intermédiaires, mobilisant différentes caractéristiques pour représenter chaque chiffre et effectuer progressivement le calcul.

Ces études ne sont pas seulement techniques ; elles racontent une histoire. Elles montrent comment un système apparemment opaque peut être décomposé en éléments compréhensibles, comment la complexité peut être apprivoisée par la rigueur méthodologique.

Limites et Perspectives : Vers une Compréhension Plus Profonde

Malgré leur élégance et leur utilité, les graphes d’attribution ne capturent qu’une partie du tableau complet. Ils ignorent notamment certains aspects dynamiques du fonctionnement des modèles neuronaux, comme les mécanismes d’attention qui permettent au modèle de se concentrer sur des parties spécifiques de l’entrée.

Cependant, ces limites ne diminuent pas la portée de cette méthode. Au contraire, elles soulignent la nécessité d’explorer davantage ce domaine encore jeune qu’est l’interprétabilité mécanique. Les auteurs appellent leurs pairs à poursuivre cette quête, à développer des outils encore plus puissants et précis pour comprendre non seulement ce que font les modèles mais pourquoi et comment ils le font.

Une Lumière dans l’Obscurité

En conclusion, cet article propose bien plus qu’une simple méthode technique. Il s’inscrit dans une démarche plus large visant à rendre intelligible ce qui semble aujourd’hui insaisissable. Les graphes d’attribution offrent une lumière dans l’obscurité des réseaux neuronaux profonds. Ils permettent aux chercheurs non seulement de mieux comprendre ces systèmes mais aussi de poser des questions fondamentales sur la nature même de l’intelligence artificielle.

Car au-delà des algorithmes et des mathématiques se cache une ambition profondément humaine : celle de comprendre nos créations pour mieux nous comprendre nous-mêmes. Et dans cette quête infinie vers la connaissance et la maîtrise, chaque avancée – aussi modeste soit-elle – est une victoire éclatante contre l’opacité.



 

Alzheimer : le rôle essentiel du sommeil profond, d’après les chercheurs

Une nouvelle étude dévoile comment le sommeil profond pourrait protéger notre mémoire malgré les signes précurseurs d'Alzheimer. Des chercheurs ont observé que les personnes bénéficiant d'un sommeil de qualité préservaient mieux leurs capacités cognitives, même en présence de protéines amyloïdes. Cette découverte ouvre des perspectives encourageantes pour lutter contre cette maladie neurodégénérative qui affecte des millions de personnes dans le monde.

- Le sommeil profond comme rempart contre le déclin cognitif

- Mécanismes d'action du sommeil sur la santé cérébrale

- Optimiser son sommeil naturellement

- Vers une approche préventive de la démence

La maladie d'Alzheimer reste l'une des formes de démence les plus répandues et dévastatrices. Pourtant, des recherches récentes suggèrent qu'un élément simple mais crucial de notre quotidien pourrait jouer un rôle déterminant dans la prévention de ses symptômes : le sommeil profond. Une équipe de scientifiques américains a mis en lumière comment cette phase spécifique du sommeil pourrait constituer un véritable bouclier contre le déclin cognitif associé à Alzheimer, même lorsque les changements cérébraux caractéristiques de la maladie sont déjà présents.

Une étude conjointe menée par des chercheurs des universités de Californie (Berkeley), Stanford et UC Irvine a examiné 62 adultes âgés en bonne santé cognitive. Ces scientifiques ont fait une découverte majeure : les participants présentant des marqueurs cérébraux d'Alzheimer, mais bénéficiant d'un sommeil profond de qualité, obtenaient de meilleurs résultats aux tests de mémoire.

Le neuroscientifique Matthew Walker de l'Université de Californie à Berkeley illustre parfaitement cette relation : " Considérez le sommeil profond comme un gilet de sauvetage qui maintient la mémoire à flot, l'empêchant d'être entraînée vers le fond par le poids des pathologies liées à Alzheimer ". Cette métaphore puissante souligne l'effet protecteur du sommeil profond contre les symptômes cognitifs malgré la présence de changements cérébraux.

Ce qui rend cette découverte particulièrement encourageante, c'est que contrairement à d'autres facteurs de risque d'Alzheimer, le sommeil est un élément sur lequel nous pouvons agir concrètement. Les chercheurs précisent que cet effet protecteur est spécifique au sommeil profond, également appelé sommeil à ondes lentes non-REM, et non aux autres phases du sommeil.

Mécanismes d'action du sommeil sur la santé cérébrale

L'accumulation de protéines bêta-amyloïdes dans le cerveau constitue l'un des marqueurs caractéristiques de la maladie d'Alzheimer. Ces protéines peuvent commencer à s'agglomérer des décennies avant l'apparition des premiers symptômes. Des recherches antérieures avaient déjà établi un lien entre sommeil perturbé et niveaux élevés de ces protéines.

Le sommeil profond semble offrir au cerveau une opportunité cruciale d'éliminer les déchets métaboliques accumulés pendant la journée, dont ces protéines potentiellement nocives. Ce processus de " nettoyage cérébral " pourrait expliquer pourquoi un sommeil de qualité protège contre le déclin cognitif, même lorsque les marqueurs biologiques d'Alzheimer sont présents.

Zsófia Zavecz, neuroscientifique à UC Berkeley et auteure principale de l'étude, affirme : " La présence de pathologies cérébrales ne condamne pas automatiquement à des symptômes cognitifs ou des problèmes de mémoire ". Publiés dans la revue BMC Medicine, les travaux suggèrent que certains facteurs liés au mode de vie, en particulier le sommeil profond, peuvent atténuer l'impact de ces changements biologiques.

Optimiser son sommeil naturellement

À la différence des somnifères qui induisent souvent un sommeil superficiel et s'accompagnent d'effets secondaires, la recherche souligne l'importance d'améliorer naturellement la qualité du sommeil. Pour favoriser un sommeil profond réparateur, les experts recommandent plusieurs pratiques simples :

- Éviter la caféine en fin de journée.

- Pratiquer une activité physique régulière.

- Limiter l'exposition aux écrans avant le coucher.

- Prendre une douche chaude avant de se mettre au lit.

Ces habitudes saines peuvent contribuer significativement à augmenter la durée et la qualité du sommeil profond, renforçant ainsi la résistance cognitive face aux changements cérébraux liés à Alzheimer.

Vers une approche préventive de la démence

Cette étude s'inscrit dans un corpus grandissant de recherches suggérant que le sommeil représente un facteur de risque modifiable dans le développement de la maladie d'Alzheimer. Bien que l'échantillon soit relativement restreint, ces résultats ouvrent des perspectives prometteuses pour des interventions préventives simples et accessibles.

Les chercheurs soulignent par contre la nécessité d'études longitudinales sur de plus longues périodes pour confirmer si l'amélioration du sommeil profond peut effectivement préserver les fonctions cognitives sur la durée, malgré l'augmentation des niveaux de protéines bêta-amyloïdes.

La qualité du sommeil pourrait ainsi devenir un élément central des stratégies de prévention contre la démence, aux côtés d'autres facteurs protecteurs comme l'éducation, l'activité physique et les connexions sociales. Un simple changement dans nos habitudes nocturnes pourrait contribuer à protéger notre cerveau contre l'une des maladies les plus redoutées du vieillissement.

Si vous voulez devenir artiste, n'allez pas aux Beaux-Arts. Travaillez dans un club échangiste, un asile, devenez chasseur de primes, faites la guerre. On devient conteur en ayant une histoire intéressante à raconter. On ne devient pas poète en allant à l'université.